为培养学生综合实践能力，学校打破学科专业壁垒，实施综合性教学实习。如生物学综合大实习、动物生产类综合大实习，以及整合生物学、基因工程、细胞工程、酶工程等课程的生物技术综合大实习，促进了学生综合实践能力的提高。
学校全面推行工程训练实习，所有本科专业学生均参加工程训练实习。其中农科、理科、经管文法类专业安排1周的工程训练实习，工科类专业安排2周工程训练实习，机械类专业安排4周工程训练实习，进一步增强学生现代工程意识，拓宽学生的知识视野。
为实现立德树人的教育目标，该校将思想理论课融入实践体系，以思政实践3学分的方式培育学生的“三农”情怀。如，学校在2012年启动的“田园使者”活动，每年选聘1000余名优秀本科生担任杨凌农业示范区“田园使者”和杨凌周边农业技术员助理，进入现代农业生产园地，开展农业生产和营销实践锻炼，让学生在广阔的农村天地接受“三农”教育，培育“三农”情怀。
赴长武黄土高原农业生态试验站实践队的一位队员在日记中写道：“身为农大学子，致力于农业现代化建设，不到田间地头走一走，不到试验台前动一动，不到农村看一看，就无法体会学农的责任和骄傲，暑期实践坚定了我们服务三农的。”
特色：导师制提升学生科研能力
根据农业科研实践能力要求高、研究周期长的特点，按照学生的科研能力发展需求，学校创新性地构建了从自主实验到创新性实验计划项目，再到导师指导下科研训练的渐进式、本研贯通的全学程科研训练。
这种创新形成了一年级自主进实验室，二年级选定导师、申请和实施大学生创新性实验计划项目，三、四年级做研究论文的全程科研训练体系，达到了学术导师一对一全面指导学生的科研训练，使大学生创新实验计划、科研训练、毕业论文实现了有机结合。
为导师指导效果，学校对导师招收创新班学生的条件、人数等方面进行了明确的要求，对于导师指导科研训练的内容和要求进一步细化，每学期进行科研训练的时间累积不少于两周，考核合格后计实践教学2学分，导师的指导按照学校的相关教学工作量予以认定。导师指导学生的投入和培养质量也作为导师招收学生的重要参考内容。这些措施的实施，使得导师对创新班学生的生源期待与指导学生认真开展科研训练得到了有效结合，从而确保了科研训练的质量。
学生的全程科研训练被纳入实践课程体系，使学生的创新素质与科研能力培养有专门课程依托。如对瓦赫宁根大学的科研基本方法、科研写作课程进行吸收引进，供学生必修。学生的科研创新能力考核被放在与课程成绩同等重要的地位，作为学生是否能够进行贯通培养的基本要求。同时，对于考核优秀的学生在进入硕博和直博培养通道时，可享受优秀博士生源学金。