第一，减少普惠制受益国数量，将受益者集中于经筛选的国家。在新方案中，虽然享受普惠制待遇的产品范围和关税优惠率没有变化，但是有一批原来的受益国从名单中删除。不再享受欧盟普惠制待遇的国家有三类：( 1) 根据世界银行的分类，已属于高收入或中等偏高收入的国家，如沙特阿拉伯、卡塔尔、白俄罗斯、俄罗斯、巴西、科威特等国；( 2) 其进入欧盟产品享受的优惠待遇至少相当于或超出普惠制的待遇，如贸易协定或特殊自动贸易制度下的待遇；( 3) 一些享受替代准入安排进入发达市场的海外国家和领土。根据欧盟委员会的，目前享受欧盟进口优惠的 176 个国家和地区将减至约 80 个。
第二，通过实施普惠制追加安排，增强激励受益国尊重核心与劳工、、良治、和可持续发展标准。
第三，通过实施“除军火外之一切”安排，增强最不发达国家贸易进入欧盟的效率和效益。欧盟认为，减少普惠制受益国的数量意味着减少最不发达国家出口的竞争压力，从而使它们享受的优惠待遇更具有实际意义。欧盟标榜，认为其对最不发达国家的这种特殊普惠制安排是任何其他发达国家的普惠制所不能媲美的。
第四，增强普惠制实施的透明度、稳定性和可预见性。欧盟的普惠制将是式的，尽管目前每 3 年要进行一次审查和评估，这将更容易吸引欧盟进口商从普惠制受益国购买商品。此外，普惠制的实施程序将更加透明、清晰并有更加确定的法律原则予以规制。
2012 年 6 月 13 日，欧洲议会在一读程序中就投票通过了自 2014 年起欧盟对发展中国家贸易实施新的普惠制安排。安排将享受标准优惠制的国家数量从 176 个减少到 75 个左右；享受优惠的进口总值从 2009年的 600 亿欧元减少到约 377 亿欧元。
随后，2012 年 10 月 4 日，欧盟理事会通过了修改现行欧盟普惠制条例的决议。[12]该决议基本维持了委员会的议案和欧洲议会先前所表达的支持立场。与此同时，该决议重申并特别强调：
首先，欧盟普惠制的旨在使欧盟普惠制适应变化的全球情势，使欧盟普惠制方案对于最需要国家的更加透明、更具有可预见性和更加的优惠。近几年来，在全球经济危机和欧债危机的影响下，不仅欧美等发达国家的经济持续低迷，而且广大的发展中国家深受其害。在这种背景下，欧盟认为，其及时调整普惠制方案，实属必要。
其次，欧盟普惠制的重点和核心是将其普惠制措施集中于最不发达国家和中低等收入国家。新的普惠制方案将主要基于发展国家的经济收入状况来选定受益国。在新的方案中，已经与欧盟缔结了贸易协定并享受优惠待遇的国家被在普惠制受益国之外，自动享受安排的国家也不在普惠制受益国之列。调整后的普惠制受益国数量将减少约 50%。