我国与“一带一”沿线国家和地区发展跨境电子商务面临的另一大阻碍，是物流通道基础设施建设滞后。比如，我国和中亚一些国家的铁标准不统一，导致铁运力明显不足；民航方面，我国具备与中亚相关国家通航条件的大型机场少，直航航线更少；其他方面的基础设施连接情况也比较差，这些因素都直接影响着跨境电商物流的健康快速发展。
“一带一”在中国境内涉及西北、东北、西南、东部、中部等地区的18个省级行政区，但是这些省份电子商务发展水平参差不齐。现阶段，东部地区的电子商务发展成熟，其中，浙江、广东、福建具有较好的电子商务发展基础，浙江省有电商百佳县41个，福建省有16个，广东、广西、云南、新疆的百佳电商县均不足15个，有9个省市区的电商百强县则是空白。总体来看，西北地区省份的电子商务发展落后，东北地区省份处于中下发展水平，西南地区省份具有一定的电子商务基础，只有东南沿海地区省份的电子商务发展成熟，具备深化开拓跨境电子商务的条件和能力。
而在2012年开始，跨境电商服务试点在上海、重庆、郑州、杭州、宁波五个城市启动，2013年10月以后，这一试点在全国有条件的地方开始全面扩展，这一轮的试点主要是在物流集散地、口岸或是产品生产地等，这些地区因为物流优势和产地优势具有发展跨境电子商务更好的条件和基础。相较而言，部一些地区虽然地处一带一沿线的优良地理，但由于电商发展不够成熟影响了其跨境电商的供给能力，从而在流通效率和产品结构上影响了跨境电商的发展。
由于经济发展、基础设施、消费等差异，与“一带一”区域跨境电商相匹配的各项优惠政策在各个地区能够发挥的效应和促进作用出现极大差异，东部地区借助优惠政策正在甚至已经将跨境电商培育为中国新常态时期新的区域经济增长点，而西北等地区尚在境内电子商务平台上进行海外代购的跨境电商尝试，对诸多优惠扶持政策尚不能有效把握和利用。例如，福建和新疆分别承载着丝绸之核心区的功能，也是对外的主要窗口，但是，福建物流基础好，人均收入高，消费能力强，能够成为跨境电商的主要消费地，而新疆更多的只是承担口岸建设和对外窗口职能，在消费力上则不能同日而语。
同样，在“一带一”战略下，各省市区也结合当地实际情况积极进行对接，以实现地区经济新的发展。沿线省份更是抓住机遇补齐自身短板，与国际接轨，增加对周边国家的投资，加强与周边国家的经济文化交流，促进跨境贸易和跨境电子商务发展。可以说，“一带一”战略实施如何很大程度上要依靠地方的政策配套与执行。因而，“一带一”沿线省份对政策红利的把握程度也会影响跨境电子商务的发展条件和发展水平。