《太上洞玄宝元上经》云:“凡学无上之法，仰观天文，俯察地理。天地之本，本无形也;无形者，是道也。应物成有，有形有名，名天地者，道之孙，一之子也。”天地乃道所生，因此，要证道必须上观天下察地，“仰观，俯察下地，然后内观洞晓中也。洞晓中者，存三一也。存三一者，先观天文，次察地理。”
不但在天文、地理、医药、化学方面有许多科学贡献，而且在物理学领域也有不菲的科学思想发微。典籍中散见有许多关于声、光、磁、热思想，中人所阐发的时空观、运动观中不乏科学思想的精萃，有些甚至是中国物理学思想的创始。科技思想相当丰富，除了按科学分类，可分为思想、医药养生学思想、天文学思想、地理学思想、数学思想、物理学思想、生态学思想外，在科学思维和科学研究方方面也蕴育形成了深刻的科学思想，主要体现在:在炼制金液还丹之类的教实践活动中，业已孕育并初步形成了“仰观俯察”、“观变察机”、“参验”、“勤求试之”、“析理入微”、“原始返终”、“由易及难”的科学思维方法与思维方式。
相比其他教，除了对哲学思想体系的贡献，在自然科学方面的贡献最大。天文学，化学，植物学，医学，地理测绘学，矿物学，光学等等。