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目前几乎没有信息是关于在铅毒性应答时植物miRNA的表达模式或调控作用的。南京农业大学柳李旺教授带领的研究团队从水平上对萝卜在铅(Pb)下的调控网络和反应机制进行了研究,研究发表在7月刊的Plant Molecular Biology Reporter上。
萝卜是一种重要的根菜类蔬菜作物,其肉质直根为可食用部分。重金属对萝卜的种植和生产有重大影响。越来越多的显示,microRNA(miRNA)介导的基因调控在重金属应答中起着重要作用。不过,目前几乎没有信息是关于在铅毒性应答时植物miRNA的表达模式或调控作用的。南京农业大学柳李旺教授带领的研究团队从水平上对萝卜在铅(Pb)下的调控网络和反应机制进行了研究,研究发表在7月刊的Plant Molecular Biology Reporter上。
研究人员通过高通量测序和降解组分析(降解组测序项目由联川生物承担完成),对Pb下的萝卜进行了全基因组水平的miRNA鉴定并探讨了miRNA调控的靶基因。实验从两个萝卜根文库中(一个是未经处理的萝卜根,另一个是Pb的萝卜根)共鉴定出74个已知的和173个潜在的新miRNAs。其中,25个已知的和9个新发现的miRNAs有显著差异表达,并鉴定为Pb应答miRNAs。降解组分析显示,1979对miRNA-mRNA靶向本很有可能被剪切。GO分析表明,这些靶向本主要参与调控,防御反应和结合相关的功能。Pb应答miRNAs调控的靶基因主要参与相关信号的和传导,特定金属的吸收,以及体内平衡机制。另外,研究人员通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,对20个Pb应答miRNAs和6个靶基因的表达模式进行了验证。
此研究结果表明,miRNA在Pb时,发生显著地差异表达,在Pb应答过程中起到调控作用。研究结果也为植物应答Pb时miRNA介导的调控网络和机制提供了基本见解。
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