通过专业评估，学校启动了新一轮人才培养方案的修订工作，要求各专业制定人才培养质量标准体系，落实文化知识和思想品德相结合、创新思维和社会实践相结合、全面发展和个性发展相结合的人才培养要求。为了达到这个目的，学校在专业评估启动之时，同步启动人才培养方案修订工作，在评估过程中专家与院领导班子、专业负责人、专业教师进行面对面讨论，逐一课程进行修改。
通过专业评估，学校启动了“卓越人才培养计划”，探索科学基础、实践能力和人文素养融合发展的人才培养模式。学校出台了《农业大学卓越人才培养方案修订的指导意见》，指导思想全面贯彻科学发展观和党的教育方针，遵循高等教育规律，以人为本，“重素质，夯基础，强能力，扬个性”的育人。主要以素质教育为基础，以创育为核心，以优势和特色专业为依托，以优质资源为保障，以试点专业为突破口，不断探索拔尖创新人才和应用型人才培养模式。培养目标主要是培养崇尚科学、基础深厚、视野开阔、德才兼备、适应经济社会发展需要的拔尖人才和富有创新、实践能力、有献身国家农林事业志向、解决农林业生产实际问题能力的高水平应用型人才。
通过专业评估，进一步提高了教育教学质量，体现了学校始终把本科教学作为最基础、最核心的一项工作。在评估过程中每个专业都有一位校领导亲自参加，听取专家意见、研究专业发展、解决专业问题，对评估过程中发现的专业师资不足、梯队不合理的问题，学校在当年招聘教师中优先解决。学校根据专业和人才培养结构调整，优先为本科专业进行资源配置，评估后拿出专项经费用于本科专业整改。学校注重评估的科学分析与全面应用，并适时进行了人事制度和分配制度，加大了本科教学认定及职称评定权重。可以说，通过评估工作，学校从“领导精力、师资力量、资源配置、经费安排和工作评价”等方面突出了教学工作的核心地位，为全面提升教育教学质量提供了保障。
农业大学是省属高等农业院校，通过历时三年的专业评估工作，学校深刻体会到制约内涵发展的核心问题是人的问题，无论是发展定位、专业特色、教学水平，还是科研能力、国际交流等，如果有一支学术水平高、学术的师资队伍，专业评估过程中发现的绝大多数问题都能很好地解决。在专业评估过程中发现，教与学的矛盾冲突特别大，一方面学生渴望听到大师们的讲课，学到更多的知识和能力；而另一方面教师希望学生们都能饱满地学习，彻底改变现在大众化教育下学生的学习状态。要想解决这个矛盾，教师在教学研究、教学方法、考核方式等方面就需要下更大的力气、花更多的时间，才能够真正提高人才培养质量。而引导教师潜心研究教学、特别是培养青年教师尽快成长，就需要在政策上鼓励教师，解决教师、特别是青年教师的后顾之忧，在导向上引导教师重视教学，在教师评价、考核、职称评定等具有指挥棒的关键点上加大教学权重，在经费上加大对教师培养的支持力度，使青年教师尽快成长，从而提升学校的整体育人能力，全面提高人才培养质量。