“白蝶贝能够存活的地方不多，目前在海南还可以找到，在雷州半岛已经很难被发现。”中国水产科学研究院南海水产所研究员喻达辉的一句话，反映了区的尴尬现实。
广东渔政乌石中队工作人员刘乃仁是刘张村老渔民，他亲历了白蝶贝资源的变化。上世纪70年代，这里的渔民每天都可以捞到白蝶贝，刘乃仁就曾见过50多公分大的白蝶贝。
1994年，区内发现经济贝类长竹蛏，吸引很多人前来偷捕。偷捕者往往将渔获物统统带走，这种涸泽而渔的行为殃及白蝶贝，白蝶贝资源由此遭受严重。
“白蝶贝活动能力弱，基本不能主动游动，很容易被全歼。”喻达辉说。至今，这种被严禁的作业方式仍然频繁出现，即使在区也难幸免。
经济发展令徐闻珊瑚礁区面临同样的窘境。中科院南海所2004年和2008年的调查结果显示，徐闻珊瑚礁的珊瑚覆盖率呈明显下降趋势，水质变差，沉积物增加，透明度减少，成为珊瑚死亡和品种单一化的直接原因。
徐闻所处的纬度是珊瑚礁分布的边缘，生态系统十分脆弱，现实情况导致“徐闻珊瑚礁生态系统处于极度不健康状态”。中科院南海所研究员黄晖是该区建立的推动者，面对现状，她既心疼又无奈。
黄晖认为，和全球珊瑚礁受到气候变化而大面积死亡的情况不同，我国珊瑚礁面临的主要问题是人为活动。
此外，中越北部湾划界和渔业合作协定于2004年生效以后，广东在北部湾减少了3.2万平方公里的高产优质渔场。
在徐闻，记者看到的奇特景观之一是珊瑚房子。这种据说是冬暖夏凉的房子，成为上世纪五六十年代“珊瑚利用”的明证，也诉说着人类经济与发展需求下的生态悲歌。
海岸带之 殇
“我生在海边，长在海边，小时候红树林一片一片的，如果不被，绝对比米埔湿地还漂亮。”说到此，雷州半岛珍稀海洋生物区管理局局长欧春晓语带笑意。
然而这都是历史的记忆。记者在雷州乌石国家海洋公园看到的唯一一片红树林，因为是两村争议之地才侥幸得以保留。鱼排（养殖筏）下近乎黑色的海水更令人印象深刻。
中国海洋大学海洋发展研究院教授刘洪滨告诉记者：“南方个别养殖区，看着是一层水，下面比下水道还恶劣。养殖筏下都是淤泥和堆积的饵料，有的甚至厚达1米！”
徐闻珊瑚礁区管理局局长刘炜说：“徐闻优势品种鹿角珊瑚严重衰退，而耐受的角孔珊瑚成为区新的优势种。”
白蝶贝人工繁殖技术在上世纪70年代初就取得突破，但到80年代后期人工养殖则出现一系列问题。