南京农业大学果树学科历史悠久，基础雄厚，其前身为原中央大学和金陵大学园艺系，曾培养了曾勉、吴耕民、王业遴等一大批著名园艺学家；分别于1986年和2000年获硕士、博士学位授予权，1998年被批准设立园艺学博士后流动站，2000年获园艺学一级学科博士学位授予权。本学科现系江苏省重点学科，是国家现代农业（梨）产业技术体系建设的依托单位，注重理论联系实际、科学研究与推广开发相结合，促进了我国果树科技进步和产业的发展；并与植物学、植物生理学、生物化学、遗传学、生物学、生物信息学、土壤学、植物营养学、气象学、植物病理学、昆虫学以及材料工程学等均有密切的联系。目前已培养了200多名高素质的研究生。 果树学科现有教师22人，其中教授11人，副教授3人，11人曾在国外学习或1年以上。近十年来共承担省部级科研项目50多项，其中国家自然科学基金16项，科研经费总数近4000万元。近年来获国家科技进步二等1项，省部级科技共6项，其中教育部科技进步二等2项；教育部自然科学二等1项；江苏省科技进步二等2项；江苏省农业科技三等1项；发表论文300余篇，其中SCI文章80余篇。毕业研究生一部分继续深造，一部分到高等院校、科研院所、农业科技推广部门及企业工作。
南京农业大学蔬菜学科历史悠久，基础雄厚，其前身为原中央大学和金陵大学园艺系，曾培养了毛良、李曙轩、曹寿椿、陆子豪等一大批老一辈国际知名园艺学家；分别于1982年和1986年具有硕士、博士学位授予权，1998年被批准设立园艺学博士后流动站，2000年获园艺学一级学科博士学位授予权，2002年蔬菜学科被评为国家级重点学科，2009年园艺学一级学科被认定为江苏省一级学科国家重点学科培育建设点。本学科牵头的“现代园艺科学”交叉学科获江苏高校优势学科建设工程项目资助。本学科已形成了四个特色鲜明的研究方向：蔬菜遗传育种、设施蔬菜栽培、蔬菜生理生态、蔬菜生物学。注重理论联系实际、科学研究与推广开发相结合，促进了我国蔬菜科技进步和产业的发展；并与植物学、植物生理学、生物化学、遗传学、生物学、土壤学、植物营养学、气象学、植物病理学、昆虫学以及材料工程学等均有密切的联系。近年来购置了流式细胞仪、细胞遗传工作站等先进精密实验仪器，提高了学科的科研总体实力。“不结球白菜优异种质创新方法及其应用”荣获2006年国家技术发明二等；“温室关键装备及有机基质的开发应用”本学科作为第二参加单位获2009年国家科学技术进步二等。作为作物遗传与种质创新国家重点实验室的重要组成部分，科研及教学设施条件大为改善，目前学科已在蔬菜作物品质改良、功能基因组、蛋白质组学等相关研究领域具备了居国内一流、国际先进水平的研究设施和条件。经江苏省、教育部、农业部批准，近年来先后成立了江苏省十字花科蔬菜种质资源基因库、园艺作质创新与利用教育部工程研究中心、农业部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室等科研平台。 本学科现有教授10名、副教授11名，其中，博士生导师8名、硕士生导师14名。具有硕士学位、博士学位的教师分别达100％和75%；形成了一支以中青年学术