在对液相色谱系统进行使用的时候，为了将相关效能更好的发挥出来，就应当要明确相关原理。它主要是在经典液相色谱法的基础之上，引入气象色谱理论，继而迅速发展起来。与经典液相色谱法相比较，存在一定的区别，主要表现是填料颗粒小，同时非常地均匀。主要的原因在于，较小的填充颗粒具有高柱效，不过会引起高阻力，需要高压输送流动相，因而也被称之为高压液相色谱仪。
在对液相色谱系统进行使用的时候，需要将液体待测物注入色谱柱内，并通过压力在固定相当中移动，因被测物种不同物质，与固定相的相互作用不同，不同的物质顺序，离开色谱柱，通过检测器，得到不同的峰信号。通过分析比对，这些信号判断物质所含有的物质。它作为一个尤为重要的分析方法，已经被广泛应用于化学及生化分析当中。它主要是由多个部件组成，主要包括流动相储液瓶、输液泵、进样器及色谱柱等等，它的整体组成与气相色谱相类似。然而针对流动相，为液体的特点作出更多调整。因液体流动相黏度要比气体高，为了减低柱压，色谱柱通常比较粗，长度也远小于气相色谱柱。
正是因为它具有如此多的性能特点，因而被广泛应用于诸多领域当中。对混合物进行分离，只要求样品能制成溶液，不受样品挥发性的限制，流动相可以选择的范围宽，固定相的种类相对繁多，为此能够分离不稳定及非挥发性及各种分子量范围的物质。因它具有高分辨率，灵敏度相对较高，色谱柱能够反复利用，流出组分则容易收集。未来一段时期，高效液相色谱仪与结构仪器的联用，则是一个重要的发展方向。