当然，不论金融体系中的哪类机构，也不论是一级市场还是二级市场，绿色金融的风险管理都是一个值得特别重视、需要认真研究、科学应对的问题。
康书生：要使绿色金融有效推动我国经济绿色转型并使绿色经济可持续发展，仅强调金融系统的社会责任是不够的，因为金融系统的主体是商业组织，其经营活动具有天然的趋利性，即便是政策性金融机构，其资金性质与运作方式与财政比较，也具有本质性区别。这就要求部门必须市场经济规律，出台一系列配套政策措施，最大程度保障绿色金融的市场化运作。其中主要有以下三个方面：
首先是绿色经济发展的宏观法规、政策及规划。规范、调整金融机构及产业、企业的经营行为，保障致力于绿色经济发展的产业、金融双方的利益。保障了产业、企业的利益，也就减轻了金融系统的风险和压力。
其次是支持绿色经济发展的财政税收政策措施。这些政策措施既对从事绿色经济的产业、行业、企业、项目提供免税、减税、贴息、、贷款豁免等方面的支持，又对开展绿色金融服务的金融系统给予减免税收、贴息降息、注资、贷款收购等方面的优惠，降低金融系统开展绿色金融业务的风险预期，切实金融系统的合理利益，调动金融机构的积极性。达到以较少的财政资金撬动大量金融系统资金投入绿色经济领域的效果，使绿色金融支持绿色经济发展具有内生性和可持续性。
第三是建立以为主导、产业金融等参与的协同运作机制。参与各方充分沟通交流信息，聚焦支持重点，协调政策措施，协同防控风险，合力实现绿色金融推动经济绿色转型和绿色经济持续发展的目标。