自2002年实现了1991年提出的自主创建中国大学评价体系后，武书连将主要精力转向文献计量学的研究。这是因为在多年的大学评价实践中，他深深地感到国内外现有的引文数据库难以满足《中国大学评价》的需要，建立新的数据库已经提上日程。
2010年7月，经过6年的时间，武书连研发的《科学引文数据库》实现网上查询。《科学引文数据库》（Science Citation Database 简称：SCD），是武书连研发的中国第一个涵盖自然科学、工程与技术、农林科学、医药科学、人文科学、社会科学等全部非保密学科的大型引文数据库。SCD的应用领域之一就是作为《中国大学评价》、《中国大学研究生院评价》源期刊数据库，用于评价中国普通本科高校和以创新为主的科研机构的群体创新能力。当然，SCD还可广泛应用于多个领域。
2012年9月，武书连启动了国际期刊的SCD数据库的建设。自2014年开始，武书连将不再使用长期占据中国科技界的SCI、SSCI、A&连2013中国学院毕业生质量100强
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