企业制度是经济体制的微观基础。构建高水平社会主义市场经济体制，首先必须建立和完善中国特色现代企业制度。所谓企业制度，是指企业的财产制度或资本组织形式，即企业的出资人是以什么样的财产组织形式如独资、股份制、上市公司等进行投资，从而形成企业的法人财产的。财产制度和资本组织形式是企业的基本制度。现代企业制度，是建立在社会化大生产和市场经济基础上的企业制度，其典型形式是现代公司制度，内容主要包括：一是采取公司法人制度，即任何人（包括自然人和法人）的财产，一旦投入企业，就变成企业的法人财产，企业的出资人财产权与公司法人财产权是相对分离的，公司法人财产权与企业经营权也是相对分离的；二是承担有限责任，即公司以其法人财产对其经营和债务承担有限责任，投资者以其投资额对企业承担有限责任；三是具有公司结构，即具备对公司进行治理的各项制度安排，股东会、董事会、监事会、经理层等各负其责、各司其职、有效制衡。
中国特色现代企业制度，是建立在公有制为主体、多种所有制经济共同发展，按劳分配为主体、多种分配方式并存，社会主义市场经济体制等社会主义基本经济制度基础之上的现代企业制度。中国特色现代企业制度党对国有企业的领导与建立现代企业制度相结合。习总指出，党对国有企业的领导是重大原则，必须一以贯之；建立现代企业制度是国有企业的方向，也必须一以贯之。
按照中央关于深化国有企业的顶层设计，建立和完善中国特色现代企业制度，必须继续深化以下几个方面的。一是深化公司制股份制。加大集团层面公司制力度，积极引入各类投资者，实现股权多元化。推进国有企业改制上市，逐步实现集团公司整体上市，形成股权结构多元、股东行为规范、内部约束有效、运行高效灵活的经营机制。二是健全公司结构。加强董事会建设，建立健全权责对等、运转协调、有效制衡的决策执行监督机制。规范董事长、总经理行为，充分发挥董事会的决策作用、监事会的监督作用、经理层的经营管理作用、党组织的核心作用，实现规范的公司治理。把加强党的领导和完善公司治理统一起来，明确国有企业党组织在公司结构中的地位，创新国有企业党组织发挥核心作用的途径和方式。三是实行国有企业领导人员分类分层管理制度。党管干部原则与董事会依法产生、董事会依法选择经营管理者、经营管理者依法行使用相结合。根据不同企业类别和层级，实行选任制、委任制、聘任制等不同选人用人方式。四是企业薪酬分配制度。建立和完善既符合企业一般规律又体现国有企业特点的分配机制。建立健全与劳动力市场基本适应、与企业经济效益和劳动生产率挂钩（能增能减）的工资决定和正常增长机制。对国有企业领导人员实行与选任方式相匹配、与企业功能性质相适应、与经营业绩相挂钩的差异化薪酬分配办法。五是深化企业用人制度。建立健全企业各类管理人员公开招聘、竞争上岗等制度。建立分级分类的企业员工市场化公开招聘制度。建立健全以合同管理为核心、以岗位管理为基础的市场化用工制度，形成企业各类管理人员能上能下、员工能进能出的合理流动机制。