三是生源问题。且不说我国高等教育学龄人口逐步减少的宏观背景，单就独立学院迁址的去中心化而言，就极大地降低了对生源的吸引力。毕竟对家长和学生而言，选的不仅是学校的名气，也是学校所在的城市。独立学院迁入的城市，交通、医疗、治安、周边等都将与南京相差甚远，必然对招生分数和生源质量造成冲击。南京医科大学康达学院2013年从南京迁至连云港办学后，当年理科、文科录取线分。
四是校园孤岛问题。迁入新校址后，独立学院面临着一个校园文化的再生问题，一方面是脱离公办母体高校，难以凝聚母体高校的文化积淀，另一方面其所在的区域大多远离地方核心区，缺乏一定的文化底蕴，由此很可能造成校园文化的荒漠化以及师生归属感、认同感的降低。2013年3月，因感于新校区“杨林校区太荒凉了，与社会接触的机会少，不利于学生个人发展，找工作非常不方便”等原因，云南师范大学商学院杨林校区发生“潮”。
当然，解决这些问题，也不是没有办法。美国20世纪90年代产生的一种新型大学——相互作用大学，或可为“迁址办学”的独立学院学习借鉴。相互作用大学的核心就是“以他方为中心”，通过高校与社会的密切合作，解决当地具体问题，服务地方经济社会发展。独立学院也应全面对接所在区域的地方、企业、科研院所，促进资源要素的双向流动与优化配置，形成校地和谐共生、互动双赢的局面，从而获得可持续发展的基石。我们期待，独立学院“出金陵”后，能把“出城记”写得更加动人、更加精彩。