在深水忠对生物44Y课程之前，这门课一直遵循传统的烹饪手册式的指导方法，学生们按照实验手册一步步实验获得已知的答案。深水忠思考，如果将教师的科研项目与教学相结合，教学的效果会不会更好?2010年，深水忠开始尝试新的教研融合方法，20名学生参与课程试点。按深水忠的要求，学生们需要在他所设定的参数范围内，作出假设并收集数据，而后共享数据检测他们所作的假设，并在10周内以和论文形式公布他们的发现。整个学习过程中，深水忠及助教为学生提供了极其细致的指导，包括如何架构科学问题、统计分析数据和以正确形式撰写论文。
深水忠的教学创新并不是单打独斗地进行。除了试点课程的设计上获得了所在系的支持，他还得到了斯坦福大学教育研究生院的支持，帮助他对比教研融合式的教学模型与原来的烹饪手册指导式的教学模型并提供反馈。
总结深水忠的教研融合成功原因，主要在于四点。首先，教师需要对融入教学的科研内容进行简化。在你的科研项目中，选择数据收集和问题分析方面最简单和有趣味性的那一部分，能帮学生专注于实际的科学过程。深水忠说。其次，小型团队合作的形式是学生获得较好科研体验的关键。第三，和教育评估团队合作，让他们评估学生学习情况，为教师提供及时反馈，告诉教师哪些举措是有效的。最后，资金的保障必不可少。
为什么本科生要做科研?就国外高校的经验来看，本科生做科研并不是个别学生的业余爱好，它被视为大学本科教育的一部分，对培养创新人才和提高人才培养质量具有重要意义。国内高校在本科生科研方面起步较晚，配套制度亟待完善。如何借鉴国外高校在本科生科研方面的，以多种参与形式激发本科生对科研创新的兴趣，帮助学生具备从事科研活动所需的素养能力，是值得思考的问题。