一些名牌大学的药学专业就业情况是很不错的。如，中国药科大学、大学医学部药学院、沈阳药科大学、四川大学华西药学院等院校的毕业生就业率接近100%，总体供需比率能够达到1∶3至1∶4。刘云表示，中国的制药业若要摆脱依赖仿制药、进口药的局面，需要更多的专业人才加入到新药开发的队伍中来。其中，很多专业高质量人才还常稀缺的，有些院校的药物制剂、天然药物化学等专业学生供需比甚至达到1∶10，非常抢手。
药学的主要专业方向有药物化学、药物分析、药剂学、药理学等。在这些专业方向中，药物化学(主要是药物合成)的就业形势是最好的，人才缺口最大，工资也非常高。但是药物合成接触的试剂都是毒性很大的，性很大。另外，药物分析专业就业面也比较广，而且薪金待遇也不错。再次就是药剂学、药理学、天然药物化学、中药化学等。药剂学近几年有所降温，但是，如西药药剂等专业对人才还是有很大的需求量。药理学虽然就业面较窄，但只要涉及研发新药，不管西药中药、外企国企，都需要做药理实验。在选择职业时，很多人宁可去做药品销售，也不愿做驻店执业药师。面对这种情况，李女士说：“最关键的是含金量和收入不成比例。”执业药师和注册会计师、执业律师一样，都由国家统一考试、注册，而考试通过率仅约20%，而且还要定期接受继续教育，执业门槛较高，但其在药店的收入没有体现其含金量，所以很多执业药师都放弃药店，流向了一些工资较高的药企或医疗服务机构。
目前我国高等院校药学毕业生虽然很多，但真正的一线岗位还是缺口不小。尤其在新的《药品管理法》出台后，药品的管理越来越规范严格，要求销售处方药和甲类非处方药的零售药店必须配备驻店执业药师或药师以上药学技术人员。但现状是，我国药店众多，而具有执业药剂师资格的人员仅有约22.6万人(截至2012年底)。按欧美国家每800人至1500人就配有一名执业药师的标准计算，我国执业药师的数量远远不能满足需求。
目前，全国本科阶段开设药学专业的高校有180多所，开设药学专业的院校主要可以分为两类：一类是专业药学院校，主要代表院校有中国药科大学和沈阳药科大学等;另一类是综合性大学开设的药学院系，如大学药学院、复旦大学药学院、四川大学华西药学院等。根据院校的侧重不同，专业方向的优势也不同。如大学、协和医学院—大学医学部、中国药科大学、第二军医大学的药学专业是国家级重点学科。沈阳药科大学、复旦大学、四川大学的药剂学被评为国家重点学科。而医科大学、南京医科大学、中南大学、中山大学的药理学方向是国家级重点学科。