钱学森教授指出：“中医的现代化可能引起医学的，而医学的可能要引起整个科学的”，“21世纪医学的发展方向是中医”，钱学森作为大科学家正是从世界科学发展趋势的高度，指出了蕴藏于中医药中的整体系统思维优势在未界科学发展中的引领作用。21世纪世界科学包括生命科学正发生着性的深刻变革，当还原论思维面对着复杂科学问题和复杂人体疾病日益显示出其局限性时，向东方整体系统思维回归到中国传统哲学中寻求思想的呼声正成为众多世界科学家的共识，中医药整体思维、天人相应、辨证论治等核心理论的科学价值正受到越来愈多的国外医学家的认可。许多国外部门想进行中医药的合作和研究，包括欧美发达国家都在欢迎中药的注册，许多跨国制药公司在布局中药研发并购中药企业抢占市场制高点，一股中医药的世界热正方兴未艾。
遗憾的是，目前中医药出现的国外热国内冷现象令人担忧，尽管党和医并重的政策，提出扶持和发展中医药，但许多部门在具体政策环节上未能充分尊重中医药学科发展规律，究其深层次的历史原因，还与“西风东渐”与“东风西渐”的文化之争有关。伴随着文艺复兴和工业而带来的技术进步，医学得到快速发展并成为世界的主流医学，但由此而产生的还原论则带来了对中国传统文化及中医药的冲击。在中国许多新文化运动的代表性人物都不同程度的质疑或否定中医药的科学价值，胡适说：“西医能说清楚他得的什么病，虽然治不好，但是西医是科学的；中医能治好他的病，就是（因为）说不清楚得的什么病，所以中医不科学”，反映到国家政策层面，1927年当时国民曾提出“废止旧医以扫除医事卫生之障碍案”，在全国中医界奋力下未能实施。新中国成立后党和一贯支持中医药的发展，提出医并重的政策，1958年毛提出：“中国医药学是一个伟大的宝库，应当努力发掘，加以提高”，2007年党的十七大报告提出：“扶持中医药和民族医药事业发展”，2009年制定了《国务院关于扶持和促进中医药事业发展的若干意见》，2013年中医药法进入国务院法制办和立法程序，中医药发展正面临着前所未有的历史机遇和政策。
受“西风东渐”风潮的影响，否定中医科学价值的意见及各种具体政策也屡见不鲜，1950年卫生部副部长王斌提出：“中医是封建医，应随封建社会的消灭而消灭”，受到了并被免职，前几年所谓中医药“”、“假科学”之论再次泛出，受到中医界的和反击。当然这些明显否定中医的论调在当今中国是行不通的，但“西风东渐”带来的对中医科学价值的否定和还在不同程度上影响着人们对中医药科学价值的认识，一些部门自觉不自觉的决策或具体政策，形成了对中医药宏观肯定微观否定的尴尬局面，涉及到教育、科技、新药审批、专利、价格费用等多个方面。在教育方面，主要表现在对中医药自身学科规律重视不足，形成了教学的不会看病、看病的不认识中药、研究药的不懂医的三脱离现象，中医基础理论与临床实践及治疗方药的脱节，导致中医学术