总体上看，科技创新在支撑省县域特色经济发展方面正发挥出愈来愈重要的作用，但也存在许多问题和薄弱环节。(一)科技创新服务体系尚不完善。在省县域特色经济中，产学研结合不够紧密，科技向现实生产力的率还不高，高新技术产业化滞后。科技中介服务体系建设需进一步完善，科技体制步伐缓慢，适应市场经济发展的体制、机制尚未完全建立起来。(二)科技投入总量不足。虽然许多县市县域特色经济科研经费逐年在增加，但是相比于国内其他发达地区来说，仍然是不足的。这些问题的症结就在于省对增加县域经济科技投入特别是科研经费投入仍然缺乏有力的制保障措施，使县域特色经济科技整体发展水平不高。从科技支出来看，目前大多数县域科学研究与试验发展经费总支出占省内生产总值比重不足2%，资金缺口还很大。(三)科技人才严重缺乏。多数农民自身科学文化素质低，农村基层实用科技人才少，而指导型高层次人才和高新技术研发人才紧缺，又由于基层科技人员的劳动报酬普遍偏低等原因，县域科技活动人员增加缓慢甚至存在科技人员、企业技术和技术工人持续流失问题。科技人才问题已成为制约特色产业发展的重要瓶颈。(四)企业自主创新的主体作用发挥有限。省大部分县域特色企业的研发力量薄弱，科技对传统产业的提升带动能力偏弱，导致一些产业技术含量不高，产品缺乏竞争力。科技创新的主体应该是企业，但目前真正成为技术创新主体的企业比重并不高，这主要表现在两个方面：一是企业自主创新主体意识不强，对产品结构持续改进、生产技术持续优化不够重视。只有少部分企业建立了专门的产品研发机构;二是目前的许多先进技术主要还是依靠引进和模仿创新。
(一)充分发挥培育与引导职能，提升技术创新能力。地方应积极引导产业集群内企业间的合作，尤其是企业间共性技术创新和服务平台建设，不断培育创新文化。应将科技基础设施建设纳入基本建设投资计划，并安排专项资金，用于有关科研平台、等基础设施建设。可以设立科技型中小企业发展专项资金，采取资助、配套等多种方式支持科技型中小企业加快发展。用于支持企业发展的各类财政专项资金，重点向科技型企业倾斜。如怀来和涿鹿葡萄产业政策优势明显，这大大提高了省酿酒葡萄产业竞争优势。为促进产业健康发展，设有葡萄酒局、葡萄产业公司、葡萄研究所、中法农场，成立葡萄领导小组，由一名副县长或副牵头，组织协调各方关系，统一谋划产业布局，理顺长期规划与近期利益的结合，从而使怀来的葡萄产业发展形成良性循环的好局面。(二)加强县域特色产业发展科技创新体系建设。支撑县域特色产业发展的科技创新体系是一个以县域特色产业科研为基础，以特色产品推广为纽带，以高新技术产业化为特征，以人才使用为核心的总体创新体系;是一个在特定县域内与特色产业科技创新相关的组织、机构和实现创新所构成的网络体系;是以服务、提升县域特色产业创新能力和创新效率为目标的新体系。在支撑县域特色产业发展的科技创新体系中，、高等院校、科研机构、龙头企业、星火学校、农业专业技术协会、农业等为创新主体，良性互动，制度、政策和相互协调，技术、人才、资金等创新要素协同作用，从而实现科技资源的有效集成和合理配置，实现县域特色产业的快速发展。如阜平县按照“政银企户保”模式发展食用菌产业，扶持作为产业支撑，不仅使县域特色产业得到发展，也有效地推动了产业扶贫。(三)完善科技推广体系。深入实施农业科技入户工程，按照“专家进大户、大户带小户、农户帮农户”的技术推广思想，推广新品种、新技术、新模式，做到了技术要领到户、良种良法到棚，着力培育发展“一村一品”，如满城的草莓、平泉的小蘑菇等。以特色产业科技产业化带动特色经济科研，推动特色产业科技推广。结合当前各县域特色产业科技发展的新形势、新要求，再加上各地区与周边区市紧密结合的特色产业发展的新格局，提出县域特色产业科技创新推广体系。(四)建立和完善政产学研融合互动结合的新机制。可以由县级人民直接设立科技顾问团，聘请省内外知名学者，为县域特色产业发展提供战略咨询。建立与省内外知名大专院校、科研院所的战略合作关系。每年举办一次产学研对接会，解决各县特色产业中企业生产经营中的技术难题，强化科研。由县以上设立高新技术资金，专项用于省内外大专院校、科研院所科技在县域的。同时，还应进一步健全和完善市、县(区)党政科技进步目标考核指标体系和工作机制，使之成为县科技创新体系考核保障机制的主要内容，如对县域实施每两年一次的`科技考核。(五)全面提高县域特色企业科技自主创新能力。支撑县域特色产业发展的科技创新体系的技术保障机制是全面提高县域特色企业的科技自主创新能力。首先，理顺知识产权管理机构，合理确定资金渠道，根据工作需要，逐步提高专利工作专项资金;科技经费和科学技术进步的评定向具有自主知识产权的项目倾斜，把是否具有自主知识产权作为重要条件之一;有特色产业的县域要制定知识产权工作考核评价体系，争取建成具有一定影响的知识产权工作示范县市;其次，建立完善县域特色产业发展的科技开发、科技对接、科技咨询、科技信息网络等多位一体的科技服务机制，完善科技信息、科技中介、科技融资平台，发展县域特色产业的行业协会。加强各县科技信息网等网络信息平台建设，通过信息平台定期及时发布科技信息，着重加大对县域特色产业科技服务扶持力度，对特色企业面临的急、难科技问题，做到指导及时、反馈迅速。(六)大力发展农村职业教育，完善科技培训机制。县域特色产业发展大多离不开当地农业，所以积极探索科技普及新途径、加大农业实用技术培训必不可少。将县镇集中培训与进村办班培训相结合，加强农民科技培训、造就新型职业农民是新时期的一项重要任务。培训工作要切合实际，根据各地农村经济发展状况，科学制定好中长期培训规划，有目标、有步骤地组织实施。要充分运用举办科普报告，组织科普知识竞赛、送科技下乡、开展科技咨询、专家学者田间指导、互联网技术、播放科教电影和等多种形式，向广大农民传授科学知识。运用报刊、图书、、影视、音像、手机短信等传媒，采用丰富多样、生动活泼、群众喜闻乐见的形式，加大日常科普宣传力度。(七)建立多元化人才激励机制。应围绕当地战略性新兴产业紧缺人才的需求，引进一批高层次人才，着力培养本土创新型科技人才。同时，改进完善人才评价激励机制，建立多元化的激励措施，创建以励为导向、用人单位励为主体的人才励机制、建立吸引留住人才的激励机制。例如，凡引进的高层次科技人才，所涉及各类保险等社会保险由县域特色产业等用人单位按足额补交;提供住房或享有购房优惠政策;对来县域特色企业工作的高层次科技人才，家属、子女同样享有一定优惠政策，如子女入学问题能够得到妥善解决等。