吉林医药学院创办于1952年，原为中国人民解放军第四军医大学吉林军医学院，曾是一所具有历史和优良传统的军队医学院校。经国务院、批准，学院于2004年8月整体移交管理，纳入国家普通高校序列，面向全国招生。全日制在校生定额10000人。2004年已面向24个省招收新生1600人。
学院占地面积70.8万平方米，建筑面积35.6万平方米。固定资产总值4亿元。教学用房13.5万平方米，所有教室均为现代化多教室，学院全部实现了多教学。学院设有学术交流中心，可容纳学生6000多人。学院建立了完备的校园网络，园区主干网为千兆快速以太网，互联网接入办公区和学生宿舍，实现了教学、办公网络化。
学院现设置9个本科专业：临床医学、预防医学、生物医学工程、公共事业管理、药学、药物制剂、医学检验、医学影像学、护理学；8个专科专业：临床医学、营养与食品卫生、药学、医学检验技术、放射技术、医学生物技术、护理学、口腔医学。有6个一级学科：预防医学、临床医学与医学技术、口腔医学、护理学、药学、公共管理学；9个二级学科：营养与食品卫生、临床医学、医学检验、医学影像学、医学实验技术、口腔医学、护理学、药学、公共事业管理。学院有军队重点学科2个：解剖学与组织胚胎学、药剂学；军队级重点实验室2个：生物化学实验室、生理机能实验室。
学院有一支以博士、硕士为的专业师资队伍，结构合理，事业心强，教学、医疗、科研能力突出。有高级专业技术职务130人，具有博士、硕士学位162人，研究生导师31人。享受国务院特殊津贴2人；有突出贡献的中青年专家1人；有13人次先后被评为全国、全军优秀教师，7人次获解放军育才。在国家二级学术机构担任理事以上职务23人。
学院始终以教学内容为重点，以学科建设为基础，以师资培养为关键，以提高人才培训质量为核心，立足基层，办出特色的办学指导思想，注重体现专业和层次特色。注重培养“厚基础、宽口径”的复合型人才。
学院由部队转隶地方后，对学生的管理继承并发扬了军队院校的优良传统，以人为本，为学生服务；教书育人，使学生成才；严格管理，让家长放心。学院实行专任员管理制度，挑选责任心强、专业基础扎实的教师任各期班员，24小时跟班作业，为学生学习、生活提供指导和帮助。
学院教学、医疗、科研相结合，科研工作近几年取得了显著进展，具备了较强的学术