昌都藏药厂发展势头良好。昌都市藏医院下属的昌都藏药厂（医院制剂室），可生产藏药制剂250多种，其中：国药准字号品种21个（列为国家中药品种的4个）。药厂年产值1000多万元。2003年10月通过国家GMP认证，2008年通过再认证，注册的“仙露”商标为著名商标之一，除了保障医院制剂供应外，尤其是二十五味珍珠丸、二十五味珊瑚丸、二十五味松石丸、十五味黑药丸、帕珠丸等藏药十分畅销全国各地。
专病专科建设成效明显。市藏医院充分发挥藏医在治疗慢性病、疑难病、预防保健等方面的特色优势，认真贯彻落实“院有专科、科有专病、病有专药”的发展战略，加强常见病和多发病藏医临床研究，筛选出了36种藏医优势病种的诊疗方案，进一步提高了藏医诊疗水平，丰富了藏医优势学科的理论知识和诊疗方法，并深入开展藏医治疗肝胆病、糖尿病、预防保健等的临床研究，肝病科评为国家级“十一五”重点专病专科，已通过国家中医药管理局组织的评估验收，研制出的医院制剂“乙肝1-3号”疗效显著。
藏医药科研显著。藏医药防治大骨节病科研荣获全区科技进步一等。医院组织藏医药人员编写出版了《晶镜本草》《藏医常见病诊疗大全》《康区藏医药文化名人》等著作，《晶镜本草》荣获首届国家民族科技研讨会优秀论著一等、第三届中国民族图书二等、自治区科技进步二等。研制出了一些疗效良好的藏药，如防治大骨节病的“堆子丹聚丸”、治疗糖尿病的“达玛松珍”、防治白发脱发的藏药外用药液“救古美发灵”、治疗风湿的外用药膏“救古八仙膏”等。
日通民营藏医院发展良好
卡若区日通民办藏医院是首家民营藏医院，于2007年通过自治区卫生厅批准成立。医院现占地面积8107平方米，建筑面积6845平方米，现有职工62人，解决当地人员就业44人。医院目前开设床位25张，配备有CT、X光机、B超、全自动生化分析仪、全自动血液分析仪等一批先进医疗设备。
发挥特色优势，方便群众就诊。该院在工作中充分发挥自身优势，秉承和发扬了民族医药的精华，突出了藏医药的特色优势，在治疗心脑血管、乙肝、风湿性关节、糖尿病等慢性疾病及疑难杂症方面取得了显著成绩。前来就诊的不仅有本市和区内各地的患者，还有许多来自四川、云南、青海、天津等省市的患者。现年门诊量达6万余人次，年收治住院病人近千人次。特别是日通乡及周边乡镇的4800余名农牧民自医院成立以来，就长期享受藏药免费医疗。现医院每年为各地患者减免、资助医药费用达120余万元，得到社会人士的广泛认可。2008年被国家人事部、卫生部、国家中医药管理局授予“全国卫生系统先进集体”荣誉称号。2009年被市社保局认定为城镇职工医疗保险定点医院。2010年被市卫生局评定为“一级甲等藏医院”。2014年2月被市卫生局认定为农牧区新型合作医疗定点医院。